Джон Филлипс написал более пятидесяти книг о Библии, включая полный комплект комментариев к Новому Завету и комментарии к многим книгам Ветхого Завета. Известный автор, проповедник Леман Страус утверждал, что два тома комментариев к Псалмам доктора Филлипса – это лучший труд на эту тему со времен «Сокровищницы Давида» Чарльза Сперджена. По словам многих исследователей Библии, никакой другой труд не сравним с комментариями Дж. Филлипса к книге Притчей. Джон верил, что худшее, что проповедник может сделать для тех, кого старается просветить в Писании, это представить Библию «скучной».